Protein–RNA interactions for Protein: P45985

MAP2K4, Dual specificity mitogen-activated protein kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP2K4P45985 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP2K4P45985 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP2K4P45985 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP2K4P45985 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MAP2K4P45985 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MAP2K4P45985 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MAP2K4P45985 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MAP2K4P45985 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MAP2K4P45985 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MAP2K4P45985 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MAP2K4P45985 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MAP2K4P45985 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP2K4P45985 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP2K4P45985 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MAP2K4P45985 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MAP2K4P45985 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MAP2K4P45985 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms