Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
TNNT2P45379 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
TNNT2P45379 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TNNT2P45379 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TNNT2P45379 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms