Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX2-1P43699 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX2-1P43699 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX2-1P43699 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NKX2-1P43699 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NKX2-1P43699 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NKX2-1P43699 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms