Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MAGEA1P43355 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAGEA1P43355 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAGEA1P43355 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms