Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER3P43115 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTGER3P43115 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTGER3P43115 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms