Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTTP42858 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTTP42858 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTTP42858 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTTP42858 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTTP42858 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTTP42858 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTTP42858 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTTP42858 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTTP42858 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTTP42858 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTTP42858 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HTTP42858 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTTP42858 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HTTP42858 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HTTP42858 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTTP42858 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTTP42858 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTTP42858 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTTP42858 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTTP42858 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTTP42858 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HTTP42858 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTTP42858 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTTP42858 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTTP42858 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTTP42858 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTTP42858 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTTP42858 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTTP42858 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTTP42858 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTTP42858 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTTP42858 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTTP42858 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTTP42858 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTTP42858 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTTP42858 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTTP42858 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTTP42858 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTTP42858 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HTTP42858 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTTP42858 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTTP42858 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HTTP42858 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTTP42858 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTTP42858 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTTP42858 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HTTP42858 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HTTP42858 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTTP42858 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HTTP42858 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTTP42858 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTTP42858 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTTP42858 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HTTP42858 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HTTP42858 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HTTP42858 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HTTP42858 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HTTP42858 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTTP42858 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTTP42858 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HTTP42858 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTTP42858 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTTP42858 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTTP42858 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTTP42858 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTTP42858 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTTP42858 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HTTP42858 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178 ms