Protein–RNA interactions for Protein: P42765

ACAA2, 3-ketoacyl-CoA thiolase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA2P42765 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACAA2P42765 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAA2P42765 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAA2P42765 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms