Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNFSF9P41273 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNFSF9P41273 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNFSF9P41273 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms