Protein–RNA interactions for Protein: P40550

PDR11, ATP-dependent permease PDR11, yeastyeast

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR11P40550 IPK1YDR315C 846 nt7.46□□□□□ -1.21
PDR11P40550 YPR195CYPR195C 330 nt7.46□□□□□ -1.21
PDR11P40550 MSB3YNL293W 1902 nt7.46□□□□□ -1.22
PDR11P40550 KNS1YLL019C 2214 nt7.45□□□□□ -1.22
PDR11P40550 FHN1YGR131W 525 nt7.45□□□□□ -1.22
PDR11P40550 MRC1YCL061C 3291 nt7.45□□□□□ -1.22
PDR11P40550 QDR3YBR043C 2070 nt7.45□□□□□ -1.22
PDR11P40550 YJL068CYJL068C 900 nt7.44□□□□□ -1.22
PDR11P40550 UBC4YBR082C 447 nt7.44□□□□□ -1.22
PDR11P40550 OAC1YKL120W 975 nt7.44□□□□□ -1.22
PDR11P40550 BUD28YLR062C 378 nt7.44□□□□□ -1.22
PDR11P40550 ROX3YBL093C 663 nt7.44□□□□□ -1.22
PDR11P40550 YBR016WYBR016W 387 nt7.44□□□□□ -1.22
PDR11P40550 GPT2YKR067W 2232 nt7.43□□□□□ -1.22
PDR11P40550 HEM14YER014W 1620 nt7.43□□□□□ -1.22
PDR11P40550 SNZ3YFL059W 897 nt7.43□□□□□ -1.22
PDR11P40550 SNZ2YNL333W 897 nt7.43□□□□□ -1.22
PDR11P40550 HSF1YGL073W 2502 nt7.42□□□□□ -1.22
PDR11P40550 ARO2YGL148W 1131 nt7.42□□□□□ -1.22
PDR11P40550 UTP7YER082C 1665 nt7.42□□□□□ -1.22
PDR11P40550 YRF1-4YLR466W 4149 nt7.41□□□□□ -1.22
PDR11P40550 FAA4YMR246W 2085 nt7.41□□□□□ -1.22
PDR11P40550 GUA1YMR217W 1578 nt7.41□□□□□ -1.22
PDR11P40550 POM33YLL023C 840 nt7.4□□□□□ -1.22
PDR11P40550 OST3YOR085W 1053 nt7.4□□□□□ -1.22
PDR11P40550 ACF2YLR144C 2340 nt7.4□□□□□ -1.22
PDR11P40550 GEP3YOR205C 1671 nt7.4□□□□□ -1.23
PDR11P40550 SCW4YGR279C 1161 nt7.39□□□□□ -1.23
PDR11P40550 PRP45YAL032C 1140 nt7.39□□□□□ -1.23
PDR11P40550 MIM2YLR099W-A 264 nt7.39□□□□□ -1.23
PDR11P40550 RPN6YDL097C 1305 nt7.39□□□□□ -1.23
PDR11P40550 KEL1YHR158C 3495 nt7.39□□□□□ -1.23
PDR11P40550 IES1YFL013C 2079 nt7.38□□□□□ -1.23
PDR11P40550 BAP2YBR068C 1830 nt7.38□□□□□ -1.23
PDR11P40550 YML6YML025C 861 nt7.38□□□□□ -1.23
PDR11P40550 RPN7YPR108W 1290 nt7.38□□□□□ -1.23
PDR11P40550 DFG5YMR238W 1377 nt7.38□□□□□ -1.23
PDR11P40550 PAT1YCR077C 2391 nt7.37□□□□□ -1.23
PDR11P40550 SCM3YDL139C 672 nt7.36□□□□□ -1.23
PDR11P40550 MTQ2YDR140W 666 nt7.36□□□□□ -1.23
PDR11P40550 RPN12YFR052W 825 nt7.36□□□□□ -1.23
PDR11P40550 JAC1YGL018C 555 nt7.36□□□□□ -1.23
PDR11P40550 MET8YBR213W 825 nt7.36□□□□□ -1.23
PDR11P40550 YPL277CYPL277C 1464 nt7.36□□□□□ -1.23
PDR11P40550 PRE7YBL041W 726 nt7.35□□□□□ -1.23
PDR11P40550 BGL2YGR282C 942 nt7.35□□□□□ -1.23
PDR11P40550 HIR1YBL008W 2523 nt7.34□□□□□ -1.23
PDR11P40550 ATP1YBL099W 1638 nt7.34□□□□□ -1.24
PDR11P40550 YDR514CYDR514C 1452 nt7.33□□□□□ -1.24
PDR11P40550 ECM10YEL030W 1935 nt7.32□□□□□ -1.24
PDR11P40550 ENT2YLR206W 1842 nt7.32□□□□□ -1.24
PDR11P40550 PPM1YDR435C 987 nt7.32□□□□□ -1.24
PDR11P40550 COQ6YGR255C 1440 nt7.32□□□□□ -1.24
PDR11P40550 MNN10YDR245W 1182 nt7.31□□□□□ -1.24
PDR11P40550 YIL060WYIL060W 435 nt7.31□□□□□ -1.24
PDR11P40550 MTQ1YNL063W 945 nt7.31□□□□□ -1.24
PDR11P40550 RPL3YOR063W 1164 nt7.31□□□□□ -1.24
PDR11P40550 ECM30YLR436C 3825 nt7.3□□□□□ -1.24
PDR11P40550 YAP1YML007W 1953 nt7.3□□□□□ -1.24
PDR11P40550 PIF1YML061C 2580 nt7.3□□□□□ -1.24
PDR11P40550 MSH1YHR120W 2880 nt7.29□□□□□ -1.24
PDR11P40550 YJR012CYJR012C 624 nt7.29□□□□□ -1.24
PDR11P40550 VPS5YOR069W 2028 nt7.28□□□□□ -1.24
PDR11P40550 FET3YMR058W 1911 nt7.28□□□□□ -1.24
PDR11P40550 SKN1YGR143W 2316 nt7.28□□□□□ -1.24
PDR11P40550 RPB4YJL140W 666 nt7.27□□□□□ -1.24
PDR11P40550 CLB1YGR108W 1416 nt7.27□□□□□ -1.25
PDR11P40550 LAS21YJL062W 2493 nt7.27□□□□□ -1.25
PDR11P40550 MLF3YNL074C 1359 nt7.27□□□□□ -1.25
PDR11P40550 HRP1YOL123W 1605 nt7.26□□□□□ -1.25
PDR11P40550 NSG2YNL156C 900 nt7.26□□□□□ -1.25
PDR11P40550 AVT4YNL101W 2142 nt7.25□□□□□ -1.25
PDR11P40550 EMP46YLR080W 1335 nt7.25□□□□□ -1.25
PDR11P40550 MND2YIR025W 1107 nt7.25□□□□□ -1.25
PDR11P40550 CAM1YPL048W 1248 nt7.25□□□□□ -1.25
PDR11P40550 MGR2YPL098C 342 nt7.25□□□□□ -1.25
PDR11P40550 VTS1YOR359W 1572 nt7.24□□□□□ -1.25
PDR11P40550 YDR541CYDR541C 1035 nt7.24□□□□□ -1.25
PDR11P40550 SEH1YGL100W 1050 nt7.24□□□□□ -1.25
PDR11P40550 COX18YGR062C 951 nt7.24□□□□□ -1.25
PDR11P40550 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt7.24□□□□□ -1.25
PDR11P40550 TRP5YGL026C 2124 nt7.24□□□□□ -1.25
PDR11P40550 SSK1YLR006C 2139 nt7.23□□□□□ -1.25
PDR11P40550 VPS70YJR126C 2436 nt7.23□□□□□ -1.25
PDR11P40550 YLR317WYLR317W 435 nt7.23□□□□□ -1.25
PDR11P40550 YOL131WYOL131W 327 nt7.23□□□□□ -1.25
PDR11P40550 FEX1YOR390W 1128 nt7.22□□□□□ -1.25
PDR11P40550 FEX2YPL279C 1128 nt7.22□□□□□ -1.25
PDR11P40550 DCC1YCL016C 1143 nt7.22□□□□□ -1.25
PDR11P40550 JEM1YJL073W 1938 nt7.22□□□□□ -1.25
PDR11P40550 ULA1YPL003W 1389 nt7.22□□□□□ -1.25
PDR11P40550 CCR4YAL021C 2514 nt7.22□□□□□ -1.25
PDR11P40550 APJ1YNL077W 1587 nt7.21□□□□□ -1.25
PDR11P40550 IDP1YDL066W 1287 nt7.21□□□□□ -1.25
PDR11P40550 BIM1YER016W 1035 nt7.21□□□□□ -1.25
PDR11P40550 YJL171CYJL171C 1191 nt7.21□□□□□ -1.25
PDR11P40550 OAZ1YPL052W 879 nt7.21□□□□□ -1.25
PDR11P40550 TOM5YPR133W-A 153 nt7.21□□□□□ -1.25
PDR11P40550 GDT1YBR187W 843 nt7.21□□□□□ -1.25
PDR11P40550 ASH1YKL185W 1767 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.4 ms