Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 TRK2YKR050W 2670 nt7.05□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 KSS1YGR040W 1107 nt7.05□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 PPR1YLR014C 2715 nt7.04□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 YEH1YLL012W 1722 nt7.04□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 RPT1YKL145W 1404 nt7.04□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 NOP8YOL144W 1455 nt7.04□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 EDC3YEL015W 1656 nt7.03□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 YOL036WYOL036W 2286 nt7.03□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 UGO1YDR470C 1509 nt7.03□□□□□ -1.28
YRF1-2P40105 ICE2YIL090W 1476 nt7.02□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 ALT1YLR089C 1779 nt7.02□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 GLN3YER040W 2193 nt7.02□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 SUA5YGL169W 1281 nt7.01□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 POM33YLL023C 840 nt7.01□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 GDT1YBR187W 843 nt7.01□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 YMR111CYMR111C 1389 nt7.01□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 BUL1YMR275C 2931 nt7.01□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 YHR045WYHR045W 1683 nt7.01□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 ICL2YPR006C 1728 nt7□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 PRP24YMR268C 1335 nt7□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 GCD11YER025W 1584 nt7□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 IES1YFL013C 2079 nt7□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 YJL068CYJL068C 900 nt7□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 SMF2YHR050W 1650 nt6.99□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 BGL2YGR282C 942 nt6.99□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 ARN1YHL040C 1884 nt6.99□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 KNS1YLL019C 2214 nt6.99□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 CLN1YMR199W 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 PRP45YAL032C 1140 nt6.98□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 YPR123CYPR123C 435 nt6.98□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 MID1YNL291C 1647 nt6.98□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 SCT1YBL011W 2280 nt6.97□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 WTM1YOR230W 1314 nt6.97□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 GFD1YMR255W 567 nt6.97□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 CAM1YPL048W 1248 nt6.97□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 YPR195CYPR195C 330 nt6.96□□□□□ -1.29
YRF1-2P40105 FET3YMR058W 1911 nt6.96□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 YJL171CYJL171C 1191 nt6.96□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 RPP0YLR340W 939 nt6.96□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 MLC2YPR188C 492 nt6.96□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 ECM30YLR436C 3825 nt6.95□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 TOS4YLR183C 1470 nt6.95□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 MSB3YNL293W 1902 nt6.95□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 AVO1YOL078W 3531 nt6.95□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 TUB2YFL037W 1374 nt6.95□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 LYS5YGL154C 819 nt6.94□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 TOM5YPR133W-A 153 nt6.94□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 DED81YHR019C 1665 nt6.94□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 GWT1YJL091C 1473 nt6.94□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 YML6YML025C 861 nt6.93□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 RPN7YPR108W 1290 nt6.93□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 YAP1YML007W 1953 nt6.93□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 PXR1YGR280C 816 nt6.93□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 MTQ1YNL063W 945 nt6.93□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 BAP2YBR068C 1830 nt6.92□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 HSF1YGL073W 2502 nt6.92□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 PRP31YGR091W 1485 nt6.92□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 MSH1YHR120W 2880 nt6.92□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt6.92□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 TAX4YJL083W 1815 nt6.92□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 STL1YDR536W 1710 nt6.91□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 VAM7YGL212W 951 nt6.91□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 YIL060WYIL060W 435 nt6.91□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 MRS1YIR021W 1092 nt6.91□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 PPM1YDR435C 987 nt6.9□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 SNZ3YFL059W 897 nt6.9□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 SNZ2YNL333W 897 nt6.9□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 MVD1YNR043W 1191 nt6.9□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 UBC4YBR082C 447 nt6.9□□□□□ -1.3
YRF1-2P40105 GYP1YOR070C 1914 nt6.9□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YDR053WYDR053W 396 nt6.9□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 ROX3YBL093C 663 nt6.9□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 VTS1YOR359W 1572 nt6.9□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 STB5YHR178W 2232 nt6.89□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YDR134CYDR134C 411 nt6.89□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 OAC1YKL120W 975 nt6.89□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 COQ6YGR255C 1440 nt6.89□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 VPS4YPR173C 1314 nt6.89□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YHR214WYHR214W 612 nt6.88□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YAR066WYAR066W 612 nt6.88□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 CCR4YAL021C 2514 nt6.88□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 DRN1YGR093W 1524 nt6.88□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 DFG5YMR238W 1377 nt6.87□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 TAF10YDR167W 621 nt6.87□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.87□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 SKN1YGR143W 2316 nt6.87□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 GEP3YOR205C 1671 nt6.87□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 SCW4YGR279C 1161 nt6.87□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 SCO2YBR024W 906 nt6.87□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 LCP5YER127W 1074 nt6.86□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YIL171W-AYIL171W-A 453 nt6.86□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YJL220WYJL220W 453 nt6.86□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 UTP7YER082C 1665 nt6.84□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 PYC1YGL062W 3537 nt6.84□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 AVT4YNL101W 2142 nt6.84□□□□□ -1.31
YRF1-2P40105 YDR514CYDR514C 1452 nt6.84□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 NSG2YNL156C 900 nt6.84□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 NHP6AYPR052C 282 nt6.84□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 DIT2YDR402C 1470 nt6.83□□□□□ -1.32
YRF1-2P40105 MTQ2YDR140W 666 nt6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.7 ms