Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR2IP36954 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2IP36954 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2IP36954 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms