Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E1P36543 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATP6V1E1P36543 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms