Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP214P35658 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP214P35658 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP214P35658 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP214P35658 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP214P35658 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP214P35658 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP214P35658 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP214P35658 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP214P35658 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP214P35658 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP214P35658 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP214P35658 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP214P35658 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP214P35658 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUP214P35658 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUP214P35658 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUP214P35658 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP214P35658 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP214P35658 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP214P35658 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP214P35658 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP214P35658 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP214P35658 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUP214P35658 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP214P35658 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP214P35658 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP214P35658 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP214P35658 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP214P35658 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP214P35658 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUP214P35658 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUP214P35658 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NUP214P35658 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP214P35658 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP214P35658 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP214P35658 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP214P35658 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP214P35658 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP214P35658 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP214P35658 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP214P35658 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP214P35658 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP214P35658 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NUP214P35658 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NUP214P35658 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms