Protein–RNA interactions for Protein: P35613

BSG, Basigin, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSGP35613 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSGP35613 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSGP35613 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSGP35613 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSGP35613 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSGP35613 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSGP35613 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BSGP35613 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BSGP35613 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BSGP35613 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BSGP35613 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BSGP35613 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSGP35613 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSGP35613 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSGP35613 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSGP35613 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSGP35613 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BSGP35613 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BSGP35613 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSGP35613 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSGP35613 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSGP35613 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSGP35613 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSGP35613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSGP35613 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSGP35613 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSGP35613 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSGP35613 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BSGP35613 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms