Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT9P35527 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT9P35527 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT9P35527 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT9P35527 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT9P35527 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT9P35527 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT9P35527 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT9P35527 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT9P35527 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT9P35527 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT9P35527 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT9P35527 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT9P35527 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT9P35527 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT9P35527 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT9P35527 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT9P35527 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT9P35527 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT9P35527 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT9P35527 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT9P35527 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT9P35527 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT9P35527 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT9P35527 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT9P35527 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT9P35527 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT9P35527 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT9P35527 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT9P35527 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT9P35527 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT9P35527 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT9P35527 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT9P35527 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT9P35527 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT9P35527 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT9P35527 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT9P35527 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT9P35527 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT9P35527 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT9P35527 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT9P35527 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT9P35527 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT9P35527 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT9P35527 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT9P35527 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT9P35527 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT9P35527 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT9P35527 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT9P35527 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT9P35527 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT9P35527 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms