Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BMI1P35226 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMI1P35226 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMI1P35226 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMI1P35226 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMI1P35226 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BMI1P35226 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BMI1P35226 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BMI1P35226 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BMI1P35226 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMI1P35226 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMI1P35226 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMI1P35226 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMI1P35226 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMI1P35226 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMI1P35226 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMI1P35226 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMI1P35226 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMI1P35226 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMI1P35226 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMI1P35226 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMI1P35226 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMI1P35226 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BMI1P35226 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BMI1P35226 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms