Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LSP1P33241 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSP1P33241 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSP1P33241 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSP1P33241 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSP1P33241 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSP1P33241 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSP1P33241 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSP1P33241 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSP1P33241 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LSP1P33241 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSP1P33241 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSP1P33241 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSP1P33241 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSP1P33241 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSP1P33241 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSP1P33241 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSP1P33241 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSP1P33241 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSP1P33241 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSP1P33241 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSP1P33241 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSP1P33241 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSP1P33241 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSP1P33241 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSP1P33241 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSP1P33241 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSP1P33241 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSP1P33241 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSP1P33241 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSP1P33241 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSP1P33241 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSP1P33241 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSP1P33241 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSP1P33241 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LSP1P33241 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSP1P33241 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSP1P33241 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSP1P33241 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSP1P33241 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSP1P33241 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSP1P33241 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSP1P33241 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSP1P33241 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSP1P33241 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSP1P33241 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSP1P33241 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSP1P33241 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSP1P33241 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSP1P33241 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms