Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP1P32455 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP1P32455 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP1P32455 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GBP1P32455 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP1P32455 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP1P32455 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP1P32455 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP1P32455 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GBP1P32455 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GBP1P32455 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP1P32455 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP1P32455 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP1P32455 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP1P32455 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP1P32455 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP1P32455 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GBP1P32455 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP1P32455 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP1P32455 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP1P32455 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP1P32455 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP1P32455 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP1P32455 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GBP1P32455 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP1P32455 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP1P32455 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP1P32455 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GBP1P32455 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GBP1P32455 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GBP1P32455 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBP1P32455 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP1P32455 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP1P32455 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP1P32455 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP1P32455 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP1P32455 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBP1P32455 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP1P32455 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP1P32455 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GBP1P32455 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GBP1P32455 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBP1P32455 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP1P32455 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP1P32455 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP1P32455 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP1P32455 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP1P32455 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP1P32455 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBP1P32455 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBP1P32455 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms