Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCKBRP32239 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCKBRP32239 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCKBRP32239 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms