Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3AP31941 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
APOBEC3AP31941 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBEC3AP31941 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms