Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP1P29466 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP1P29466 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP1P29466 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP1P29466 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP1P29466 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASP1P29466 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP1P29466 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP1P29466 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP1P29466 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASP1P29466 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP1P29466 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP1P29466 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASP1P29466 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP1P29466 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP1P29466 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP1P29466 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP1P29466 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP1P29466 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP1P29466 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASP1P29466 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP1P29466 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP1P29466 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP1P29466 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP1P29466 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CASP1P29466 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP1P29466 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CASP1P29466 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP1P29466 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP1P29466 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP1P29466 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP1P29466 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP1P29466 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CASP1P29466 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CASP1P29466 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CASP1P29466 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP1P29466 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP1P29466 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP1P29466 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP1P29466 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP1P29466 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP1P29466 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CASP1P29466 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP1P29466 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP1P29466 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP1P29466 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CASP1P29466 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CASP1P29466 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CASP1P29466 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP1P29466 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CASP1P29466 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CASP1P29466 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP1P29466 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP1P29466 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CASP1P29466 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASP1P29466 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASP1P29466 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms