Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARID4AP29374 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ARID4AP29374 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ARID4AP29374 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARID4AP29374 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms