Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RBL1P28749 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBL1P28749 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBL1P28749 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBL1P28749 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBL1P28749 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBL1P28749 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBL1P28749 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBL1P28749 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBL1P28749 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBL1P28749 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBL1P28749 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBL1P28749 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBL1P28749 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBL1P28749 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBL1P28749 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBL1P28749 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBL1P28749 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBL1P28749 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBL1P28749 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBL1P28749 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBL1P28749 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBL1P28749 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBL1P28749 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBL1P28749 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBL1P28749 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBL1P28749 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBL1P28749 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBL1P28749 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBL1P28749 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBL1P28749 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBL1P28749 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBL1P28749 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBL1P28749 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBL1P28749 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RBL1P28749 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBL1P28749 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RBL1P28749 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBL1P28749 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBL1P28749 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBL1P28749 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBL1P28749 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RBL1P28749 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RBL1P28749 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBL1P28749 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBL1P28749 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBL1P28749 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RBL1P28749 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RBL1P28749 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL1P28749 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL1P28749 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL1P28749 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL1P28749 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL1P28749 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RBL1P28749 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RBL1P28749 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms