Protein–RNA interactions for Protein: P28476

GABRR2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR2P28476 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABRR2P28476 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GABRR2P28476 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GABRR2P28476 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms