Protein–RNA interactions for Protein: P28331

NDUFS1, NADH-ubiquinone oxidoreductase 75 kDa subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1P28331 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFS1P28331 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS1P28331 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFS1P28331 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms