Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PLNP26678 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLNP26678 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLNP26678 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLNP26678 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLNP26678 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLNP26678 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PLNP26678 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLNP26678 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLNP26678 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLNP26678 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLNP26678 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLNP26678 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLNP26678 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLNP26678 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PLNP26678 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PLNP26678 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLNP26678 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLNP26678 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLNP26678 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLNP26678 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLNP26678 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLNP26678 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLNP26678 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLNP26678 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLNP26678 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLNP26678 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLNP26678 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLNP26678 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLNP26678 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms