Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MGAT1P26572 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MGAT1P26572 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MGAT1P26572 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms