Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
DNMT1P26358 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.32
DNMT1P26358 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
DNMT1P26358 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
DNMT1P26358 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms