Protein–RNA interactions for Protein: P25685

DNAJB1, DnaJ homolog subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1P25685 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DNAJB1P25685 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJB1P25685 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJB1P25685 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB1P25685 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB1P25685 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB1P25685 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB1P25685 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJB1P25685 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms