Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD2P25440 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD2P25440 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD2P25440 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD2P25440 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRD2P25440 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD2P25440 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD2P25440 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD2P25440 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD2P25440 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD2P25440 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD2P25440 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD2P25440 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD2P25440 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD2P25440 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD2P25440 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD2P25440 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD2P25440 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD2P25440 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD2P25440 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD2P25440 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD2P25440 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD2P25440 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD2P25440 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD2P25440 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD2P25440 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD2P25440 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD2P25440 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD2P25440 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD2P25440 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD2P25440 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD2P25440 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD2P25440 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD2P25440 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD2P25440 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD2P25440 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD2P25440 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD2P25440 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD2P25440 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD2P25440 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD2P25440 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD2P25440 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD2P25440 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD2P25440 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD2P25440 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD2P25440 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD2P25440 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRD2P25440 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD2P25440 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD2P25440 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD2P25440 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD2P25440 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD2P25440 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms