Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PTAFRP25105 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms