Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKCHP24723 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCHP24723 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCHP24723 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
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