Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFSF4P23510 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFSF4P23510 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFSF4P23510 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms