Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SP100P23497 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP100P23497 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP100P23497 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP100P23497 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP100P23497 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP100P23497 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SP100P23497 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SP100P23497 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SP100P23497 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SP100P23497 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SP100P23497 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP100P23497 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP100P23497 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP100P23497 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP100P23497 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SP100P23497 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP100P23497 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP100P23497 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SP100P23497 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP100P23497 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP100P23497 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SP100P23497 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP100P23497 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP100P23497 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP100P23497 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP100P23497 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SP100P23497 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP100P23497 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SP100P23497 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SP100P23497 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SP100P23497 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SP100P23497 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SP100P23497 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SP100P23497 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SP100P23497 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP100P23497 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP100P23497 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP100P23497 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP100P23497 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms