Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KB1P23443 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KB1P23443 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KB1P23443 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms