Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MYF6P23409 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MYF6P23409 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MYF6P23409 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MYF6P23409 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYF6P23409 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYF6P23409 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYF6P23409 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYF6P23409 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYF6P23409 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MYF6P23409 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYF6P23409 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYF6P23409 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYF6P23409 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MYF6P23409 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYF6P23409 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYF6P23409 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MYF6P23409 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MYF6P23409 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MYF6P23409 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MYF6P23409 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF6P23409 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF6P23409 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF6P23409 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF6P23409 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MYF6P23409 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MYF6P23409 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms