Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TUBG1P23258 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TUBG1P23258 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TUBG1P23258 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms