Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CDK11BP21127 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CDK11BP21127 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDK11BP21127 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.3 ms