Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA5P20719 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA5P20719 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms