Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RAB3AP20336 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms