Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC9A1P19634 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC9A1P19634 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC9A1P19634 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms