Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
VCAM1P19320 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VCAM1P19320 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VCAM1P19320 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VCAM1P19320 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VCAM1P19320 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VCAM1P19320 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VCAM1P19320 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
VCAM1P19320 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VCAM1P19320 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VCAM1P19320 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms