Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PGAM1P18669 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PGAM1P18669 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PGAM1P18669 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms