Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN2P17655 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CAPN2P17655 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN2P17655 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms