Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SMPD1P17405 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMPD1P17405 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMPD1P17405 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms