Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GCFC2P16383 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GCFC2P16383 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCFC2P16383 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms