Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSPP15924 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSPP15924 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSPP15924 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSPP15924 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSPP15924 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DSPP15924 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSPP15924 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSPP15924 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSPP15924 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSPP15924 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSPP15924 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSPP15924 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DSPP15924 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSPP15924 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSPP15924 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSPP15924 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DSPP15924 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DSPP15924 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DSPP15924 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DSPP15924 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSPP15924 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSPP15924 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSPP15924 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSPP15924 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DSPP15924 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DSPP15924 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DSPP15924 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DSPP15924 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSPP15924 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DSPP15924 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSPP15924 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DSPP15924 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DSPP15924 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSPP15924 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSPP15924 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSPP15924 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DSPP15924 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DSPP15924 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSPP15924 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSPP15924 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSPP15924 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSPP15924 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSPP15924 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSPP15924 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DSPP15924 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms