Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF3P15923 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCF3P15923 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCF3P15923 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TCF3P15923 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TCF3P15923 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF3P15923 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF3P15923 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF3P15923 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF3P15923 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF3P15923 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TCF3P15923 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF3P15923 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF3P15923 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF3P15923 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF3P15923 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TCF3P15923 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF3P15923 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TCF3P15923 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF3P15923 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF3P15923 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF3P15923 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF3P15923 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF3P15923 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF3P15923 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TCF3P15923 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TCF3P15923 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TCF3P15923 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TCF3P15923 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCF3P15923 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF3P15923 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF3P15923 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF3P15923 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF3P15923 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TCF3P15923 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF3P15923 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCF3P15923 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms