Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRA1P14867 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GABRA1P14867 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA1P14867 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GABRA1P14867 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GABRA1P14867 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA1P14867 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA1P14867 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA1P14867 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA1P14867 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA1P14867 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GABRA1P14867 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GABRA1P14867 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA1P14867 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA1P14867 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA1P14867 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA1P14867 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA1P14867 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA1P14867 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GABRA1P14867 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms