Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRF1P14222 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRF1P14222 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRF1P14222 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRF1P14222 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRF1P14222 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRF1P14222 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRF1P14222 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRF1P14222 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRF1P14222 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRF1P14222 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRF1P14222 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRF1P14222 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRF1P14222 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRF1P14222 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRF1P14222 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRF1P14222 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRF1P14222 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRF1P14222 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRF1P14222 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRF1P14222 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRF1P14222 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRF1P14222 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRF1P14222 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRF1P14222 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRF1P14222 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PRF1P14222 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRF1P14222 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRF1P14222 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRF1P14222 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRF1P14222 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRF1P14222 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PRF1P14222 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PRF1P14222 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PRF1P14222 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRF1P14222 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRF1P14222 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRF1P14222 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRF1P14222 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PRF1P14222 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms